Профессор Масааки Кимура из университета Рюку, который занялся этим подводным городом, поначалу считал, что это одна из загадок мира природы. Глыбы состоят из разновидности песчаника, который, как известно, легко поддается эрозии. Однако, при дальнейшем исследовании, Масааки обнаружил на плитах письмена, которые, к сожалению, он пока не смог расшифровать, и статуи в виде животных и людей.

Да и само сооружение не могло возникнуть из-за обычной эрозии, ведь многие блоки лежат не в тех местах, куда они могли упасть под действием силы притяжения, а выступы и отверстия имеют неприродную форму – овалы, квадраты и ромбы. Возможно, этот объект несет в себе как элементы уникального природного образования, так и следы древней цивилизации.

По мнению Масааки, пирамидам Йонагуни может быть от 3 до 10 тысяч лет, однако неизвестно, какая цивилизация их могла построить, но судя по пробам породы, это место когда-то было над водой.

Правительство Японии не признало уникальности этого места и теперь многие дайверы ездят к побережью Йонагуни, чтобы самостоятельно исследовать эту загадку мира.